PubChem

PubMed网站的有机小分子生物活性数据，是一种化学模组的数据库，由美国国家生物技术信息中心维护。提供SDF格式的化合物2D结构源文件免费下载，SDF文件亦可导入上述软件中。此外，用户还可下载化合物的ASN、XML格式的文件，以及查询计算出来的化合物性质、descriptor等。