TINKER

一款著名的从头算分子动力学软件

准确度和强大的功能，能够整合很多信息,如结构信息,实验数据等用于序列比对

使用贝叶斯方法构建系统发育树

专门为高度并行而设计的N体数值模拟程序，利用MPI和OpenMP两层并行结构对N体问题Particle-Mesh算法进行加速

通过蛋白质结构域和功能位点数据库预测蛋白质功能

免费的开源软件包，用于通过有限差分时域（FDTD）方法模拟电磁系统

基于非结构化三角形网格，专为有效模拟三维斜压循环而设计

开发的多物理场模拟软件，可进行基于有限元方法的流体力学、结构力学、声学、热力学模拟