EGO

从头计算、DFT和半经验的从头电子结构SCF-MO程序包，可以处理环境的影响和相对论效应，特别着重于开壳层分子的光谱计算

天河1A，0.772Pflops，湖南大学运营，国防科大学提供计算设备和技术支持

NCBI BLAST的免费开源并行实现。通过数据库碎片，查询分段，智能调度和并行I/O有效利用分布式计算资源，mpiBLAST将NCBI BLAST性能提高了几个数量级，同时扩展到数百个处理器。

结构力学数值模拟的免费软件，主要由EDF研发部门的“机械和声学分析”部门开发

（UStc的基于原子轨道的从头计算）是一个开源计算机代码目标是从第一原理开始的大规模电子结构模拟

一个快速的将RNA-Seq数据进行快速剪接映射的程序

一个极为流行的宇宙学模拟程序

基于密度泛函理论(DFT)和非平衡格林函数疏运方法(NEGF)的从头电子疏运代码